36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4017 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4017  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 190 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5282  hypothetical protein  27.27 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1887  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2591  putative transcriptional regulator  27.33 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393898  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06390  ArsR family regulatory protein  43.75 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1905  putative transcriptional regulator  43.08 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 472 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3321  hypothetical protein  29.58 
 
 		 180 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.669546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3105  hypothetical protein  29.58 
 
 		 181 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3091  hypothetical protein  29.58 
 
 		 181 aa  52  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3351  hypothetical protein  29.58 
 
 		 181 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  25.77 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6084  regulatory protein ArsR  36.51 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8127  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  23.86 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3541  hypothetical protein  28.89 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0530998 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  24.43 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  24.54 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3275  transcriptional regulator, ArsR family  24.83 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.42483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  23.93 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2260  transcriptional regulator, ArsR family  27.74 
 
 		 183 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1059  normal  0.463419 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  27.68 
 
 		 104 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  26.42 
 
 		 337 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1526  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  28.99 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  30.67 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  34.92 
 
 		 129 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  36 
 
 		 93 aa  41.6  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  25 
 
 		 142 aa  41.2  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 323 aa  41.2  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  39.66 
 
 		 123 aa  41.2  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>