21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1887 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1887  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6084  regulatory protein ArsR  58.72 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5341  hypothetical protein  55.7 
 
 		 165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1905  putative transcriptional regulator  50.29 
 
 		 176 aa  157  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592557  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3541  hypothetical protein  41.53 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0530998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5282  hypothetical protein  43.27 
 
 		 180 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06390  ArsR family regulatory protein  33.13 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2591  putative transcriptional regulator  30.59 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4017  regulatory protein, ArsR  29.21 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3321  hypothetical protein  20.39 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.669546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3351  hypothetical protein  19.46 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3091  hypothetical protein  19.46 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3105  hypothetical protein  19.46 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  22.93 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  22.29 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8127  transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 		 209 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1739  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0385114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1651  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  41.2  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1506  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 149 aa  40.8  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0520742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1532  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  41.2  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>