18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5282 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5282  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  360  8e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3541  hypothetical protein  45.24 
 
 		 185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0530998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1887  transcriptional regulator, ArsR family  43.27 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6084  regulatory protein ArsR  42.35 
 
 		 194 aa  98.6  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3091  hypothetical protein  28.25 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3351  hypothetical protein  28.25 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3105  hypothetical protein  28.25 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5341  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  94.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1905  putative transcriptional regulator  37.43 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3321  hypothetical protein  28.41 
 
 		 180 aa  92  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.669546  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06390  ArsR family regulatory protein  39.05 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2591  putative transcriptional regulator  31.13 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4017  regulatory protein, ArsR  27.27 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  23.86 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  23.86 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  29.69 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1111  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0673626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>