19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6084 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6084  regulatory protein ArsR  100 
 
 
194 aa  391  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1887  transcriptional regulator, ArsR family  58.72 
 
 
184 aa  197  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5341  hypothetical protein  62.42 
 
 
165 aa  170  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1905  putative transcriptional regulator  52.27 
 
 
176 aa  168  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592557  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3541  hypothetical protein  44.97 
 
 
185 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0530998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5282  hypothetical protein  42.11 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06390  ArsR family regulatory protein  39.72 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2591  putative transcriptional regulator  27.7 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3351  hypothetical protein  21.6 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3091  hypothetical protein  21.6 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3105  hypothetical protein  21.6 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3321  hypothetical protein  21.52 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.669546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8127  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4017  regulatory protein, ArsR  31.37 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94661  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  20.69 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  20.69 
 
 
188 aa  45.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  22.68 
 
 
142 aa  42.4  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1739  hypothetical protein  26.14 
 
 
149 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0385114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1506  ArsR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
149 aa  41.2  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0520742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>