115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1289 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1289  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0077  transcriptional regulator  96.34 
 
 
246 aa  487  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.53122  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1043  hypothetical protein  96.86 
 
 
223 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0030  hypothetical protein  96.86 
 
 
223 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0384  hypothetical protein  96.86 
 
 
223 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1579  hypothetical protein  96.86 
 
 
223 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1494  hypothetical protein  96.86 
 
 
223 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1200  hypothetical protein  96.86 
 
 
223 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108281  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1452  putative transcriptional regulator  55.67 
 
 
217 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293298  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4997  putative transcriptional regulator  52.43 
 
 
222 aa  228  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4136  hypothetical protein  53.05 
 
 
214 aa  222  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3788  hypothetical protein  53.05 
 
 
222 aa  221  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0435  putative transcriptional regulator  55.84 
 
 
199 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.341746  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0018  putative transcriptional regulator  52.58 
 
 
214 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4804  putative transcriptional regulator  53.37 
 
 
210 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000646734 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3358  putative transcriptional regulator  47.39 
 
 
220 aa  212  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338727  normal  0.270871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5538  putative transcriptional regulator  52.24 
 
 
209 aa  205  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.912326  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1246  putative transcriptional regulator  49.25 
 
 
203 aa  203  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2786  putative transcriptional regulator  46.89 
 
 
208 aa  199  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0896  putative transcriptional regulator  51.47 
 
 
207 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1711  putative transcriptional regulator  50 
 
 
210 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.42173  normal  0.540015 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3176  transcriptional regulator  44.66 
 
 
206 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3079  transcriptional regulator  44.17 
 
 
206 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0625169  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2998  transcriptional regulator  44.17 
 
 
206 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00441752  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3584  hypothetical protein  43.2 
 
 
206 aa  175  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001755  predicted transcriptional regulator  40 
 
 
206 aa  175  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1011  putative transcriptional regulator  43.41 
 
 
207 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1080  putative transcriptional regulator  43.41 
 
 
207 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00716  hypothetical protein  40 
 
 
204 aa  171  9e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1113  putative transcriptional regulator  43.41 
 
 
207 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1018  putative transcriptional regulator  43.9 
 
 
210 aa  170  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0995  hypothetical protein  44.17 
 
 
206 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3278  putative transcriptional regulator  42.44 
 
 
207 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0971152 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0915  putative transcriptional regulator  42.65 
 
 
218 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.949391 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2239  hypothetical protein  40.69 
 
 
205 aa  166  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0888  putative transcriptional regulator  42.31 
 
 
211 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1048  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 
207 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0028  transcriptional regulator  41.67 
 
 
217 aa  159  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.572077  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0091  hypothetical protein  40.29 
 
 
205 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4801  putative transcriptional regulator  38.83 
 
 
207 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472031 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03001  regulatory proteins, AsnC family protein  34.6 
 
 
215 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.764788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3238  putative transcriptional regulator  33.5 
 
 
211 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  33.67 
 
 
212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0414  putative transcriptional regulator  30.95 
 
 
219 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3451  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 
217 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  hitchhiker  0.00000000543336 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0425  putative transcriptional regulator  30.48 
 
 
219 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.973468  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4354  transcriptional regulator  31.3 
 
 
228 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3070  transcriptional regulator, TrmB  28.97 
 
 
215 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0423  transcriptional regulator  30.59 
 
 
227 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956901  normal  0.107177 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2284  transcriptional regulator  32.35 
 
 
214 aa  99.4  5e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.123055 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1733  transcriptional regulator  32.52 
 
 
214 aa  98.2  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.86463 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1570  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 
219 aa  93.2  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.417601  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1166  putative transcriptional regulator  34.56 
 
 
221 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3558  putative transcriptional regulator  23.27 
 
 
210 aa  88.6  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13330  predicted transcriptional regulator  29.11 
 
 
238 aa  88.2  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763143  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2493  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 
211 aa  86.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117208  normal  0.769487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2964  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 
258 aa  85.5  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  30.57 
 
 
280 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0795  putative transcriptional regulator  26.72 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2341  putative transcriptional regulator  29.76 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0136  transcriptional regulator, DeoR family  23.15 
 
 
210 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.790585  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1134  putative transcriptional regulator  29.58 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  0.0484804 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1356  putative transcriptional regulator  33.03 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5103  transcriptional regulator, DeoR family  23.15 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0402  putative transcriptional regulator  31 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2262  putative transcriptional regulator  28.79 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5097  DeoR family transcriptional regulator  22.66 
 
 
210 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2102  transcriptional regulator  30.18 
 
 
289 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.697253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4686  DeoR family transcriptional regulator  22.66 
 
 
210 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000645179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4781  putative transcriptional regulator  22.77 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5102  transcriptional regulator, DeoR family  22.66 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4828  DeoR family transcriptional regulator  22.17 
 
 
210 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00756639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4669  DeoR family transcriptional regulator  22.17 
 
 
210 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5193  DeoR family transcriptional regulator  22.17 
 
 
210 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.076054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5064  transcriptional regulator, DeoR family  22.17 
 
 
210 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1844  putative transcriptional regulator  29.17 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000755788 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2175  transcriptional regulator TrmB  28.43 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168136  normal  0.574645 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1139  putative transcriptional regulator  26.96 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.140272  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2223  putative transcriptional regulator  27.32 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000435551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2275  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171437  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1973  putative transcriptional regulator  29.56 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0303  transcriptional regulator, TrmB  29.7 
 
 
209 aa  72  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2382  regulatory protein ArsR  29.06 
 
 
274 aa  72  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.307498  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5988  putative transcriptional regulator  28.9 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  27.86 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2060  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000547125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0414  putative transcriptional regulator  24.02 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.802259  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  28.14 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21960  predicted transcriptional regulator  24.38 
 
 
275 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153457  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2549  transcriptional regulator  27.8 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11480  predicted transcriptional regulator  27.88 
 
 
209 aa  63.5  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1988  transcriptional regulator  29.68 
 
 
265 aa  62.4  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.625652  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  27.75 
 
 
213 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2510  putative transcriptional regulator  24.88 
 
 
236 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3084  regulatory protein, ArsR  29.95 
 
 
248 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00550431  normal  0.268013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2918  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2471  transcriptional regulator  27.04 
 
 
238 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3311  putative transcriptional regulator  32.21 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000054847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2435  transcriptional regulator  27.04 
 
 
238 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2480  transcriptional regulator  27.04 
 
 
238 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>