63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1344 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  447  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  57.21 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  45.24 
 
 		 214 aa  148  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  43.18 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  44.8 
 
 		 250 aa  145  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  40.76 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  40.09 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  39.81 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  41.04 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  36.19 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  39.7 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  37.23 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  37.96 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  33.81 
 
 		 261 aa  98.6  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  37.98 
 
 		 233 aa  98.6  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 215 aa  98.2  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  34.58 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  34.13 
 
 		 212 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  34.13 
 
 		 212 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  34.13 
 
 		 212 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  32.29 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  31.09 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  31.8 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  31.02 
 
 		 225 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  31.69 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  20.85 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  26.57 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  30.37 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  30.37 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  30.37 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4139  putative transcriptional regulator  29.17 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.936463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  27.32 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  31.18 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  21.99 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4354  transcriptional regulator  28.36 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  21.99 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  21.99 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  21.99 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  21.99 
 
 		 231 aa  48.5  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2638  putative transcriptional regulator  29.08 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.537278 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  20.42 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  21.99 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  28.64 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  21.47 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  21.47 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  21.47 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  25.69 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0795  putative transcriptional regulator  28.68 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  44.3 
 
 		 280 aa  45.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2543  putative transcriptional regulator  32.87 
 
 		 199 aa  45.4  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  21.47 
 
 		 231 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3451  putative transcriptional regulator  30.83 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  hitchhiker  0.00000000543336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3070  transcriptional regulator, TrmB  25.79 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272047 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5497  putative transcriptional regulator  28.76 
 
 		 241 aa  42.4  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2493  putative transcriptional regulator  33.96 
 
 		 211 aa  42  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117208  normal  0.769487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>