56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5497 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5497  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  45.22 
 
 		 212 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  41.77 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  41.78 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  40.79 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  36.56 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  38.93 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1664  putative transcriptional regulator  42.99 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.106955 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  38.93 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  38.93 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  39.83 
 
 		 226 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  28.71 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  31.08 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  27.48 
 
 		 231 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  27.48 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  27.93 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  27.48 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  25.79 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  27.48 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  27.48 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  27.48 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  26.5 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  27.03 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  27.03 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2638  putative transcriptional regulator  30.33 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.537278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  31.48 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  30.86 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  29.68 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  29.95 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  30.33 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  29.07 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4139  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.936463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  29.34 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  30.1 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  30.57 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  32.82 
 
 		 268 aa  45.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 125 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 125 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 125 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3451  putative transcriptional regulator  28.34 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  hitchhiker  0.00000000543336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4493  transcriptional regulator, ArsR family  35.59 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0808  regulatory protein ArsR  33.94 
 
 		 112 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.694563 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  24.79 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0136  transcriptional regulator, DeoR family  26.92 
 
 		 210 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.790585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 		 121 aa  42  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1844  putative transcriptional regulator  28.1 
 
 		 271 aa  42  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000755788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2681  putative transcriptional regulator  22.96 
 
 		 223 aa  42  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381379  normal  0.0939386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  36.92 
 
 		 128 aa  41.6  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>