57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4755 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  57.78 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  55.2 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  35.04 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  37.38 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  39.63 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  40.29 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  37.56 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  37.56 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  37.56 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  40.39 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  36.06 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  35.21 
 
 		 242 aa  101  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  37.2 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  34.76 
 
 		 231 aa  98.2  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  33 
 
 		 215 aa  95.5  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  36.28 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  29.02 
 
 		 266 aa  88.6  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  37.23 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  32.8 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  35.61 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  32.84 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  35.32 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  26.43 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  33.96 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  22.56 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  28.73 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  21.83 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  31.02 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0346  putative transcriptional regulator  33.52 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.20823  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  21.72 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  21.54 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  28.25 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  21.72 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  21.83 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  22.84 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  21.83 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  21.32 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  21.21 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  21.21 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  20.81 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  29.26 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  29.82 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  29.82 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  29.82 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  28.24 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1664  putative transcriptional regulator  30.73 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.106955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0414  putative transcriptional regulator  27.38 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.802259  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  27.14 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2638  putative transcriptional regulator  27.86 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.537278 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  30.32 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  24.86 
 
 		 213 aa  42  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0303  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 209 aa  41.6  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.117195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>