45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2349 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  50.47 
 
 		 250 aa  178  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  48.82 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  45.24 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  42.08 
 
 		 242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  37.56 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  36.05 
 
 		 266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  37.98 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  38.76 
 
 		 227 aa  108  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  37.13 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  37.09 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  35.15 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  37.21 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  37.21 
 
 		 259 aa  94  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  37.39 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  37.39 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  37.39 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  33.65 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  33.5 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  26.36 
 
 		 284 aa  67  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  31.32 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  34.12 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  29.63 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  28.86 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  18.75 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1563  transcriptional regulator, TrmB  39.66 
 
 		 115 aa  49.7  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.223033  normal  0.067732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  28.37 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  26.67 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  31.55 
 
 		 233 aa  48.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  28.16 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  30.19 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  30.19 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  30.19 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  26.19 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  20.11 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2638  putative transcriptional regulator  28.71 
 
 		 244 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.537278 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  20.9 
 
 		 231 aa  42  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  20.11 
 
 		 231 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>