65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1638 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  424  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  37.38 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  38.03 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  39.04 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  34.63 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 261 aa  86.3  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  34.91 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  30.81 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  38.86 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  38.86 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  38.86 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  38.86 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  31.47 
 
 		 266 aa  81.6  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  36.53 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  35.24 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  33.49 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  32.13 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  32.21 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  30.7 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  30.99 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  36.28 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  33.49 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  29.9 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  25.91 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  30.84 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  30.05 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  23.86 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  25.47 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  26.42 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  33.18 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  26.42 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  26.42 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  25.91 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  25.91 
 
 		 231 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  25.91 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  29.82 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  25.91 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  31.49 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  25.91 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  24.61 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  25.91 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  33.52 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  32.44 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  28.49 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  30.62 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0753  hypothetical protein  29.91 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  29.61 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  26.58 
 
 		 242 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  28.17 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2549  transcriptional regulator  32.23 
 
 		 240 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  27.5 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  31.55 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  35.62 
 
 		 200 aa  45.1  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2666  FHA domain-containing protein  25.44 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 89 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1222  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0303  transcriptional regulator, TrmB  30.53 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3344  transcriptional regulator, MarR family  41.56 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.670275  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1570  putative transcriptional regulator  29.78 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.417601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4997  putative transcriptional regulator  34.27 
 
 		 222 aa  42  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 503 aa  41.6  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0742  putative transcriptional regulator  29.21 
 
 		 177 aa  41.6  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0083196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>