33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1381 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1266  regulatory protein, ArsR  35.32 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234884 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1512  regulatory protein, ArsR  34.83 
 
 		 215 aa  117  9e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395049  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1012  putative transcriptional regulator  37.98 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.27626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0040  putative transcriptional regulator  39.82 
 
 		 224 aa  92.4  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0064  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 		 192 aa  90.5  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.348632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3312  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1333  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 305 aa  74.7  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 503 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4075  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 151 aa  67  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0843494  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1549  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.493713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3142  transcriptional regulator, ArsR family  31.96 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0826  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.09 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0859  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.85 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1230  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 330 aa  61.6  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3257  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 269 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2118  hypothetical protein  28.07 
 
 		 283 aa  54.3  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0738  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.36 
 
 		 415 aa  53.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0472  ArsR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0451  ArsR family regulatory protein  30.85 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.617366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2204  regulatory protein ArsR  27.5 
 
 		 370 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1706  regulatory protein ArsR  33.68 
 
 		 409 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1359  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.390289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 		 259 aa  45.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2339  hypothetical protein  34.52 
 
 		 117 aa  45.1  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1390  hypothetical protein  35.29 
 
 		 118 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  28.21 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 89 aa  43.5  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  30.34 
 
 		 226 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  31.13 
 
 		 196 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  32.89 
 
 		 110 aa  42  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1854  hypothetical protein  32.39 
 
 		 124 aa  42  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 		 112 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>