26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0040 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0040  putative transcriptional regulator  100 
 
 
224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1266  regulatory protein, ArsR  37.96 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.234884 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1512  regulatory protein, ArsR  44.54 
 
 
215 aa  103  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395049  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  39.82 
 
 
200 aa  92.4  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1012  putative transcriptional regulator  40 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.27626  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0064  putative transcriptional regulator  45.36 
 
 
192 aa  85.5  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.348632  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  25.31 
 
 
503 aa  72  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1549  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.493713  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0738  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
415 aa  68.2  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1333  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
305 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1230  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 
330 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3257  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.87 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0859  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.51 
 
 
234 aa  62  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0472  ArsR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4075  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 
151 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0843494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3312  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
110 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0451  ArsR family regulatory protein  24.88 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.617366  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1359  ArsR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.390289 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0826  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.93 
 
 
224 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2204  regulatory protein ArsR  32.14 
 
 
370 aa  55.8  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3142  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 
219 aa  55.5  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2118  hypothetical protein  35.35 
 
 
283 aa  53.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1706  regulatory protein ArsR  36.14 
 
 
409 aa  52.8  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
150 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0877  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 
110 aa  43.9  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.199532 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20640  regulatory protein ArsR  32.99 
 
 
310 aa  41.6  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>