27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3312 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3312  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  218  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1333  ArsR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 305 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 503 aa  105  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  38.14 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1266  regulatory protein, ArsR  37.08 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234884 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4075  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0843494  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1512  regulatory protein, ArsR  30.86 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395049  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0040  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3142  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0472  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1549  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 282 aa  50.8  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.493713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2204  regulatory protein ArsR  29.03 
 
 		 370 aa  50.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1012  putative transcriptional regulator  27.72 
 
 		 205 aa  50.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.27626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0064  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 		 192 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.348632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0826  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 		 224 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1706  regulatory protein ArsR  28.72 
 
 		 409 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0859  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.69 
 
 		 234 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1230  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.83 
 
 		 330 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3257  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.83 
 
 		 269 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0451  ArsR family regulatory protein  28.71 
 
 		 219 aa  45.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.617366  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1359  ArsR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 225 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.390289 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2175  transcriptional regulator TrmB  37.5 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168136  normal  0.574645 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1147  hypothetical protein  28.57 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0114936  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2118  hypothetical protein  23.71 
 
 		 283 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2381  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.43402  normal  0.916761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2543  putative transcriptional regulator  32.81 
 
 		 199 aa  40  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>