25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1266 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1266  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234884 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1512  regulatory protein, ArsR  38.65 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395049  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0064  putative transcriptional regulator  47.18 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.348632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  35.32 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1012  putative transcriptional regulator  37 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.27626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0040  putative transcriptional regulator  37.96 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1549  putative transcriptional regulator  45.26 
 
 		 282 aa  89  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.493713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1333  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3312  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3257  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.51 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1230  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3142  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0451  ArsR family regulatory protein  27.75 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.617366  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4075  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 		 151 aa  62  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0843494  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2204  regulatory protein ArsR  27.61 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0826  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.89 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0859  putative transcriptional regulator, ArsR family  23.96 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0472  ArsR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0738  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.55 
 
 		 415 aa  52.4  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1706  regulatory protein ArsR  31.87 
 
 		 409 aa  51.6  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2118  hypothetical protein  28.69 
 
 		 283 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1499  transcriptional regulator, TrmB  34.19 
 
 		 132 aa  41.6  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.148307  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0967  ArsR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 181 aa  41.6  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5584  transcriptional regulator, TrmB  31.91 
 
 		 307 aa  41.6  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.107073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>