22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0738 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0738  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
415 aa  836    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2118  hypothetical protein  50 
 
 
283 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0859  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
234 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0826  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 
224 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1230  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.07 
 
 
330 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3257  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 
269 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4075  transcriptional regulator, ArsR family  34.9 
 
 
151 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0843494  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3142  transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 
219 aa  90.9  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0451  ArsR family regulatory protein  43.08 
 
 
219 aa  91.3  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.617366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2204  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 
370 aa  84  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1706  regulatory protein ArsR  39.25 
 
 
409 aa  81.3  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0040  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1512  regulatory protein, ArsR  38.67 
 
 
215 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395049  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  28.36 
 
 
200 aa  53.5  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1266  regulatory protein, ArsR  29.55 
 
 
198 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.234884 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  22.12 
 
 
503 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0472  ArsR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
239 aa  50.8  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1012  putative transcriptional regulator  30 
 
 
205 aa  50.4  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.27626  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 
116 aa  47.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1333  ArsR family transcriptional regulator  22.61 
 
 
305 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0064  putative transcriptional regulator  25.62 
 
 
192 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.348632  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1359  ArsR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
225 aa  44.3  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.390289 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>