22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0472 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0472  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1359  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.390289 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3142  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0040  putative transcriptional regulator  27.62 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4075  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 		 151 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0843494  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2118  hypothetical protein  29.27 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3312  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1333  ArsR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 305 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0859  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3257  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.14 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1266  regulatory protein, ArsR  27.15 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234884 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  25.36 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0064  putative transcriptional regulator  29.7 
 
 		 192 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.348632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0738  putative transcriptional regulator, ArsR family  22.22 
 
 		 415 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1012  putative transcriptional regulator  27.5 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.27626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0826  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1230  putative transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 330 aa  49.7  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0451  ArsR family regulatory protein  23.77 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.617366  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1512  regulatory protein, ArsR  19.59 
 
 		 215 aa  46.6  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395049  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2204  regulatory protein ArsR  21.05 
 
 		 370 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1706  regulatory protein ArsR  22.73 
 
 		 409 aa  42  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>