25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0064 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0064  putative transcriptional regulator  100 
 
 
192 aa  392  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.348632  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1012  putative transcriptional regulator  56.68 
 
 
205 aa  215  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.27626  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1549  putative transcriptional regulator  60 
 
 
282 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.493713  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1266  regulatory protein, ArsR  37.86 
 
 
198 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.234884 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1512  regulatory protein, ArsR  45.76 
 
 
215 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395049  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  30.58 
 
 
200 aa  91.3  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0040  putative transcriptional regulator  45.36 
 
 
224 aa  85.9  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3257  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.22 
 
 
269 aa  63.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  27.7 
 
 
503 aa  63.2  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1230  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 
330 aa  58.9  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3142  transcriptional regulator, ArsR family  29.8 
 
 
219 aa  58.2  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0826  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.98 
 
 
224 aa  57  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4075  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 
151 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0843494  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0472  ArsR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
239 aa  51.2  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3312  ArsR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
110 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2204  regulatory protein ArsR  27.96 
 
 
370 aa  48.9  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1706  regulatory protein ArsR  30.95 
 
 
409 aa  48.5  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0859  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.19 
 
 
234 aa  48.1  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2118  hypothetical protein  31.94 
 
 
283 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1333  ArsR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
305 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  32.35 
 
 
167 aa  46.2  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  34.18 
 
 
284 aa  46.6  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0738  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 
415 aa  45.1  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1080  putative transcriptional regulator  33.87 
 
 
207 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1011  putative transcriptional regulator  33.87 
 
 
207 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>