36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3142 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3142  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 219 aa  449  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0859  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 234 aa  124  9e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3257  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1230  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.64 
 
 		 330 aa  112  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4075  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 151 aa  106  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0843494  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0826  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2118  hypothetical protein  34.97 
 
 		 283 aa  102  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0451  ArsR family regulatory protein  35.88 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.617366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0738  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 		 415 aa  90.9  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 503 aa  85.9  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2204  regulatory protein ArsR  30.66 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1706  regulatory protein ArsR  37.37 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1012  putative transcriptional regulator  33.09 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.27626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1512  regulatory protein, ArsR  26.36 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395049  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0472  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  31.96 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1266  regulatory protein, ArsR  34.65 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1333  ArsR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 305 aa  61.6  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0064  putative transcriptional regulator  29.8 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.348632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3312  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0040  putative transcriptional regulator  30.23 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1549  putative transcriptional regulator  32.58 
 
 		 282 aa  54.3  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.493713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1359  ArsR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.390289 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 104 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20640  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 310 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0549  hypothetical protein  40.98 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 86 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 		 93 aa  42.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0717  regulatory protein, ArsR  32.86 
 
 		 81 aa  42.4  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.797937 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 114 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  35.85 
 
 		 89 aa  42.7  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  32.2 
 
 		 330 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 129 aa  42.4  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 118 aa  42.4  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  35.82 
 
 		 268 aa  42  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0985  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 267 aa  42  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326764  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>