27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1012 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1012  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  413  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.27626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0064  putative transcriptional regulator  56.68 
 
 		 192 aa  201  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.348632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1549  putative transcriptional regulator  53.78 
 
 		 282 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.493713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1266  regulatory protein, ArsR  37 
 
 		 198 aa  118  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234884 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1512  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395049  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  37.98 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0040  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3142  transcriptional regulator, ArsR family  33.09 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 503 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3257  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.2 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1230  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4075  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 151 aa  64.3  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0843494  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0826  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2118  hypothetical protein  34.02 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0859  putative transcriptional regulator, ArsR family  25.56 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3312  ArsR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 110 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0738  putative transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 415 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0472  ArsR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2204  regulatory protein ArsR  28.74 
 
 		 370 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1706  regulatory protein ArsR  29.29 
 
 		 409 aa  49.3  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0451  ArsR family regulatory protein  30.08 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.617366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 472 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1333  ArsR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 305 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4997  putative transcriptional regulator  32.31 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  34.78 
 
 		 306 aa  42.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  26.74 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>