35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1148 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
503 aa  1025    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1333  ArsR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
305 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3312  ArsR family transcriptional regulator  46.73 
 
 
110 aa  105  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3142  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 
219 aa  85.9  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1266  regulatory protein, ArsR  43 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.234884 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1512  regulatory protein, ArsR  30.08 
 
 
215 aa  75.1  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395049  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  34.04 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0040  putative transcriptional regulator  25.31 
 
 
224 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1012  putative transcriptional regulator  34.19 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.27626  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4075  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 
151 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0843494  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0064  putative transcriptional regulator  27.7 
 
 
192 aa  63.9  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.348632  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2118  hypothetical protein  26.87 
 
 
283 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1147  hypothetical protein  36.96 
 
 
109 aa  62  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0114936  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0859  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.97 
 
 
234 aa  60.5  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1549  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 
282 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.493713  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3257  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.86 
 
 
269 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0451  ArsR family regulatory protein  30.61 
 
 
219 aa  58.5  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.617366  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0472  ArsR family transcriptional regulator  23.75 
 
 
239 aa  57.4  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0066  hypothetical protein  33.73 
 
 
166 aa  56.6  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0701675 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1706  regulatory protein ArsR  28.57 
 
 
409 aa  55.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2055  hypothetical protein  27.92 
 
 
175 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1409  secreted protein  30.77 
 
 
269 aa  53.9  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.894228  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0738  putative transcriptional regulator, ArsR family  22.12 
 
 
415 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  29.37 
 
 
164 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1893  hypothetical protein  32.98 
 
 
153 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.479923  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1230  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.42 
 
 
330 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0245  hypothetical protein  42.25 
 
 
111 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305068  normal  0.0996387 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2204  regulatory protein ArsR  25.23 
 
 
370 aa  49.3  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  31.58 
 
 
288 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  28.87 
 
 
140 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0826  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.7 
 
 
224 aa  47.8  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0065  hypothetical protein  29.89 
 
 
167 aa  47.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0709944 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0946  hypothetical protein  39.44 
 
 
111 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81682  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20640  regulatory protein ArsR  32.56 
 
 
310 aa  44.3  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 
89 aa  44.3  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>