24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0859 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0859  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 234 aa  461  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0826  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.1 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0451  ArsR family regulatory protein  38.68 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.617366  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3142  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 219 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3257  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1230  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.41 
 
 		 330 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2118  hypothetical protein  44.37 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0738  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 415 aa  108  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4075  transcriptional regulator, ArsR family  36.57 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0843494  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1706  regulatory protein ArsR  44.09 
 
 		 409 aa  93.2  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2204  regulatory protein ArsR  31.87 
 
 		 370 aa  90.1  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1512  regulatory protein, ArsR  29.94 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395049  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  28.4 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0040  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 503 aa  63.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1266  regulatory protein, ArsR  23.96 
 
 		 198 aa  57  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234884 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0472  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1012  putative transcriptional regulator  25.56 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.27626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  36.61 
 
 		 118 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1333  ArsR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 305 aa  49.7  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3312  ArsR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 110 aa  48.5  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0064  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.348632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1549  putative transcriptional regulator  24.8 
 
 		 282 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.493713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  33.78 
 
 		 171 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>