24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3257 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3257  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 269 aa  526  1e-148  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0826  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.15 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0859  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 		 234 aa  135  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3142  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 219 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0451  ArsR family regulatory protein  32.58 
 
 		 219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.617366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0738  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 415 aa  102  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2118  hypothetical protein  31.65 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4075  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 151 aa  93.6  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0843494  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2204  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1706  regulatory protein ArsR  39.47 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1012  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 205 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.27626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1266  regulatory protein, ArsR  26.34 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234884 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0064  putative transcriptional regulator  28.22 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.348632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1512  regulatory protein, ArsR  35.96 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395049  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1230  putative transcriptional regulator, ArsR family  56.86 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0040  putative transcriptional regulator  32.87 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  36.25 
 
 		 200 aa  57  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1549  putative transcriptional regulator  28.28 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.493713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0472  ArsR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 239 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3312  ArsR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 110 aa  45.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 		 112 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1359  ArsR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 225 aa  42  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.390289 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 114 aa  42  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>