22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1706 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1706  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 409 aa  797    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2204  regulatory protein ArsR  50.49 
 
 		 370 aa  359  5e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0451  ArsR family regulatory protein  47.69 
 
 		 219 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.617366  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0859  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 234 aa  95.9  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2118  hypothetical protein  41.46 
 
 		 283 aa  86.7  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3142  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0738  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.25 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3257  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0826  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.77 
 
 		 224 aa  79  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1230  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4075  transcriptional regulator, ArsR family  30.08 
 
 		 151 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0843494  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1512  regulatory protein, ArsR  34.74 
 
 		 215 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395049  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1266  regulatory protein, ArsR  29.38 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234884 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 503 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0040  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 224 aa  53.1  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1333  ArsR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 305 aa  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3312  ArsR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 110 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1012  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 205 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.27626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0064  putative transcriptional regulator  30.95 
 
 		 192 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.348632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  33.68 
 
 		 200 aa  47  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  35.14 
 
 		 116 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 		 116 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>