41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1872 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  100 
 
 		 116 aa  228  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  41.74 
 
 		 115 aa  96.7  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  38.05 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  38.89 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.53 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  38.68 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  35.85 
 
 		 116 aa  84.7  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  39.32 
 
 		 117 aa  83.6  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0641  transcription regulator  43.14 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  46.51 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  40.57 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  36.52 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  35.4 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  37.38 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0407  hypothetical protein  36.73 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  42.53 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  38.3 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  41.18 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  35.16 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1741  hypothetical protein  35.23 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  34.44 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0319  transcription regulator  33.64 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185486  normal  0.0870731 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1236  hypothetical protein  31.19 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  32.76 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0946  hypothetical protein  34.86 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81682  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  32.67 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  35.96 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1750  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  32.11 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0245  hypothetical protein  35.14 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305068  normal  0.0996387 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  30.91 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2555  hypothetical protein  36.04 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.981859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0147  hypothetical protein  25 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2339  hypothetical protein  30.48 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0442  regulatory protein ArsR  26 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  36.26 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1706  regulatory protein ArsR  35.14 
 
 		 409 aa  45.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1390  hypothetical protein  27.72 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0786  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.965961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>