33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1236 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1236  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  308  2e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  42.4 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  39.2 
 
 
125 aa  100  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  37.4 
 
 
131 aa  95.5  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  40.52 
 
 
125 aa  95.1  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  39.45 
 
 
119 aa  93.2  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  41.28 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5206  hypothetical protein  33.87 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  36.04 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  36.63 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  36.52 
 
 
116 aa  67  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  34.82 
 
 
116 aa  67  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  39.42 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  33.33 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  35.4 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  35.79 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  34.51 
 
 
116 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
115 aa  61.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0641  transcription regulator  40.52 
 
 
114 aa  60.8  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  30.43 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  31.9 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  31.19 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  30.08 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  38.16 
 
 
116 aa  50.8  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.83 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0946  hypothetical protein  34.57 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81682  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0245  hypothetical protein  32.26 
 
 
111 aa  47  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305068  normal  0.0996387 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0319  transcription regulator  30.11 
 
 
129 aa  46.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185486  normal  0.0870731 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1390  hypothetical protein  30.77 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0407  hypothetical protein  25 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  31.11 
 
 
110 aa  41.2  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>