44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1969 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  252  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  58.78 
 
 		 125 aa  143  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  49.62 
 
 		 125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  54.2 
 
 		 125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  46.56 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1236  hypothetical protein  38.93 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  42.86 
 
 		 119 aa  100  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5206  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  46.02 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  35.29 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  38 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  40.17 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  31.67 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  32.76 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0319  transcription regulator  40 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185486  normal  0.0870731 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  35.09 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  31.62 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  37.29 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  30.95 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  33.33 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  39.33 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  35 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.71 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  32.74 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0556  hypothetical protein  40.79 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1362  hypothetical protein  38.81 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  29.66 
 
 		 115 aa  48.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  32.93 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1152  hypothetical protein  34.25 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.314563 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1390  hypothetical protein  34.21 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0464  hypothetical protein  27.16 
 
 		 199 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000221199 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2339  hypothetical protein  37.31 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0641  transcription regulator  39.77 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0245  hypothetical protein  34.15 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305068  normal  0.0996387 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0946  hypothetical protein  32.5 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81682  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1674  transcriptional regulator TrmB  42.86 
 
 		 247 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1750  transcriptional regulator, ArsR family  30.49 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0442  regulatory protein ArsR  24.76 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0407  hypothetical protein  31.88 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0786  transcriptional regulator, ArsR family  26.8 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.965961 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>