18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1674 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1674  transcriptional regulator TrmB  100 
 
 		 247 aa  499  1e-140  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1645  ArsR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1276  hypothetical protein  31.58 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121315 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 154 aa  72  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  27.5 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  26.28 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  28.93 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  27.16 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  23.23 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  24.2 
 
 		 175 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  30.65 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.89 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  42.86 
 
 		 131 aa  46.2  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  23.27 
 
 		 204 aa  45.4  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  25.41 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  24.79 
 
 		 200 aa  42.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  25 
 
 		 174 aa  42  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  31.34 
 
 		 125 aa  42  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>