47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1726 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 167 aa  332  1e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  55.15 
 
 		 176 aa  174  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  49.7 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  47.34 
 
 		 219 aa  150  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 174 aa  90.1  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  37.32 
 
 		 208 aa  85.5  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  35.48 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  26.88 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  24.41 
 
 		 254 aa  74.7  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  33.86 
 
 		 267 aa  74.7  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  35.61 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 214 aa  70.9  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1674  transcriptional regulator TrmB  27.5 
 
 		 247 aa  67.4  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1276  hypothetical protein  28.23 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121315 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  27.12 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1645  ArsR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  26.45 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  22.31 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  26.28 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  23.28 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  27.07 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  29.01 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  27.21 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.4 
 
 		 271 aa  54.7  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  23.33 
 
 		 242 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  26.23 
 
 		 243 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  25 
 
 		 237 aa  50.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  21.85 
 
 		 249 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 485 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  27.21 
 
 		 244 aa  48.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  31.25 
 
 		 292 aa  47.4  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0064  putative transcriptional regulator  32.35 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.348632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  26.05 
 
 		 282 aa  46.6  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  51.06 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  20.66 
 
 		 248 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0581  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  37.5 
 
 		 390 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 136 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0859  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 		 234 aa  41.2  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  27.27 
 
 		 242 aa  41.6  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4075  transcriptional regulator, ArsR family  32.43 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0843494  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1954  hypothetical protein  35.82 
 
 		 120 aa  41.2  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  24.39 
 
 		 385 aa  41.2  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  26.72 
 
 		 273 aa  41.2  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>