42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2162 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 277 aa  129  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  29.82 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  29.49 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  28.9 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  28.64 
 
 		 254 aa  95.1  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  29.63 
 
 		 267 aa  92  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 282 aa  89  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  32.2 
 
 		 285 aa  86.7  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  27.98 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.44 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  28.97 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  30.85 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  32.39 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  24.77 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  29.01 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  34.33 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  24.85 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  25.94 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  26.71 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  25.38 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  25.9 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  29.75 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  24.43 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  25.26 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  27.07 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  29.86 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1674  transcriptional regulator TrmB  30.65 
 
 		 247 aa  52.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1645  ArsR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 166 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  26.42 
 
 		 205 aa  48.9  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3452  ArsR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  30.43 
 
 		 292 aa  45.8  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1276  hypothetical protein  24.49 
 
 		 185 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121315 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  23.53 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  25 
 
 		 204 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0860  regulatory protein, ArsR  32.26 
 
 		 114 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  26.98 
 
 		 175 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  23.81 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1733  hypothetical protein  25.33 
 
 		 286 aa  42  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0103078  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>