43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1756 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 267 aa  541  1e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  37.65 
 
 		 273 aa  168  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.73 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  34.47 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  38.21 
 
 		 244 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  39.06 
 
 		 285 aa  122  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  35.95 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  31.8 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  27.23 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  27.68 
 
 		 255 aa  96.7  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  25.1 
 
 		 249 aa  90.1  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  31.02 
 
 		 242 aa  89  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  30.13 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  29.07 
 
 		 237 aa  86.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  25.35 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  28.31 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  24.07 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  28.57 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  33.86 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  33.9 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  29.84 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  29.03 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  31.85 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  28.85 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  30.15 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1733  hypothetical protein  24.91 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0103078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  26.98 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  29.11 
 
 		 204 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  28.33 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  26.77 
 
 		 205 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1276  hypothetical protein  24.84 
 
 		 185 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121315 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1645  ArsR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 166 aa  45.8  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  24 
 
 		 154 aa  43.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2275  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 105 aa  43.5  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 93 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  45.65 
 
 		 475 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3971  transcriptional regulator, DeoR family  36.73 
 
 		 262 aa  42.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.229273  normal  0.573727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>