56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3377 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  61.26 
 
 		 254 aa  323  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  53.54 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  30.91 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  27.73 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  29.39 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 248 aa  95.9  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  27.57 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  26.67 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  27.05 
 
 		 242 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  27.8 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  28.95 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  30.28 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.56 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  24.52 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  25 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  25.36 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  28.97 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  31.15 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  30.77 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 174 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 485 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  26.24 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  27.4 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  31.15 
 
 		 205 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  26.11 
 
 		 385 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  25 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  23.48 
 
 		 167 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  24.06 
 
 		 170 aa  49.7  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 154 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  30.14 
 
 		 109 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  25.4 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  25.32 
 
 		 118 aa  46.2  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 134 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 121 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 107 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 121 aa  44.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 108 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  19.71 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  30.38 
 
 		 121 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.19 
 
 		 107 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  27.38 
 
 		 113 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  20.16 
 
 		 175 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3452  ArsR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 93 aa  43.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  29.11 
 
 		 104 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 102 aa  42.7  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  29.11 
 
 		 104 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 109 aa  42.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  29.85 
 
 		 103 aa  42.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  26 
 
 		 110 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 104 aa  42  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 85 aa  42  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>