32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0944 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 219 aa  445  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  71.84 
 
 		 175 aa  255  5e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  51.19 
 
 		 176 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  47.34 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  27.11 
 
 		 171 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  29.21 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  23.56 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  21.97 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1276  hypothetical protein  32.76 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121315 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  30.4 
 
 		 285 aa  58.5  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  26.06 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  27.87 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1645  ArsR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  24.11 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1674  transcriptional regulator TrmB  23.23 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  26.47 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  29.86 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  28.33 
 
 		 267 aa  53.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  28.93 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  23.97 
 
 		 385 aa  47.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  25.2 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  19.88 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  21.09 
 
 		 154 aa  45.4  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  20.17 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  20 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  25 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.6 
 
 		 271 aa  43.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  25 
 
 		 242 aa  42  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 181 aa  42  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>