26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1509 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 292 aa  577  1e-164  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0905  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0805  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.126396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2028  putative regulatory protein  37.21 
 
 		 220 aa  57  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0860  regulatory protein, ArsR  34.95 
 
 		 114 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1272  hypothetical protein  32.38 
 
 		 198 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.658952 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  34.21 
 
 		 171 aa  52.8  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 98 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1759  putative transcriptional regulator  45.28 
 
 		 134 aa  48.9  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0694565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 167 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  36.92 
 
 		 205 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  29.63 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 		 132 aa  47  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  39.62 
 
 		 118 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0775  putative transcriptional regulator  45.28 
 
 		 134 aa  46.2  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.394099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  30.43 
 
 		 253 aa  45.8  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1814  ArsR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 79 aa  45.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346706  normal  0.834101 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0703  putative transcriptional regulator  43.4 
 
 		 135 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.286988  normal  0.459468 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0264  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 88 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297288  decreased coverage  0.00633224 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1838  putative transcriptional regulator  44.68 
 
 		 120 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  hitchhiker  0.000363735 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0307  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 		 80 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0687  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 97 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0139545 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1248  regulatory protein, ArsR  35.19 
 
 		 88 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  33.93 
 
 		 244 aa  42.7  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1280  putative transcriptional regulator  40.43 
 
 		 120 aa  42.4  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>