74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0234 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  33.64 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  34.65 
 
 		 243 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  29.71 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  31.43 
 
 		 237 aa  122  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  32.14 
 
 		 254 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  26.82 
 
 		 254 aa  95.5  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  25.43 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  27.43 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  24.5 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  28.78 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  24.39 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.03 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  26.64 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  28.08 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  27.94 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  30.6 
 
 		 170 aa  72  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  27.21 
 
 		 171 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  25.38 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  24.8 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  25.37 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  26.72 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  24.32 
 
 		 485 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  24.59 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1733  hypothetical protein  23.69 
 
 		 286 aa  52.4  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0103078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  25.2 
 
 		 208 aa  52.4  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 105 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  23.57 
 
 		 385 aa  50.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  43.4 
 
 		 108 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  24.8 
 
 		 205 aa  48.9  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 106 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5180  transcriptional regulator, ArsR family  28.38 
 
 		 113 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 106 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 106 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 106 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  20.66 
 
 		 167 aa  45.4  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 106 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 106 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 110 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 154 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.74 
 
 		 118 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1972  transcriptional regulator, ArsR family  26.32 
 
 		 102 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845945  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  37.1 
 
 		 112 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4261  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0205  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.88 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0204  regulatory protein, ArsR  31.76 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.871171  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2124  arsenic resistance transcriptional regulator  39.62 
 
 		 124 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00138716  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2190  arsenic resistance transcriptional regulator  39.62 
 
 		 137 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3068  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.88 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 118 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 90 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  23.89 
 
 		 176 aa  43.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 113 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  30.12 
 
 		 104 aa  43.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 90 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 90 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 110 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 90 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 117 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 90 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 96 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 115 aa  42.4  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 298 aa  42.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  39.62 
 
 		 148 aa  42  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  35.94 
 
 		 109 aa  42  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 98 aa  42  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3119  transcriptional regulator, TrmB  35.85 
 
 		 124 aa  42  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.763432  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 157 aa  42  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>