36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2989 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  100 
 
 		 204 aa  401  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  71.21 
 
 		 205 aa  266  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  64.85 
 
 		 200 aa  252  3e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  63.5 
 
 		 214 aa  236  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  59.8 
 
 		 208 aa  221  7e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 170 aa  86.3  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 174 aa  85.5  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  35.67 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  27.05 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  28.77 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  28.77 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  27.68 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  22.66 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  31.75 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  28.87 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  25.58 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1276  hypothetical protein  27.01 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121315 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1645  ArsR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 166 aa  57.8  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  26.63 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  29.01 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  21.19 
 
 		 249 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  27.15 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  26.67 
 
 		 273 aa  50.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  25.32 
 
 		 253 aa  49.3  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  25.2 
 
 		 175 aa  48.9  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 277 aa  48.5  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 485 aa  48.9  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 154 aa  46.2  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.8 
 
 		 271 aa  45.4  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1674  transcriptional regulator TrmB  23.42 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  31.43 
 
 		 292 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  25.95 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  27.78 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  27.2 
 
 		 282 aa  42.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0581  hypothetical protein  32.47 
 
 		 121 aa  42.4  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>