35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0605 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  408  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  56.94 
 
 		 205 aa  223  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  58.05 
 
 		 200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  55.5 
 
 		 214 aa  215  4e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  57.84 
 
 		 204 aa  212  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 174 aa  93.2  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  37.32 
 
 		 167 aa  85.5  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  26.67 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  28.46 
 
 		 254 aa  71.2  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  33.87 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  25.36 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  30.77 
 
 		 254 aa  68.2  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  31.82 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  27.73 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  27.87 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  26.43 
 
 		 175 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  23.44 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  25.93 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  22.05 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  25.69 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 248 aa  52.4  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  25.31 
 
 		 385 aa  50.4  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 282 aa  49.7  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  27.95 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  23.15 
 
 		 249 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  25.2 
 
 		 273 aa  49.3  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1645  ArsR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  25.41 
 
 		 257 aa  46.6  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  27.52 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1276  hypothetical protein  20.66 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121315 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  25.96 
 
 		 252 aa  42.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  23.78 
 
 		 253 aa  42  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>