34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1817 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  500  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  76.64 
 
 		 244 aa  378  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  35.56 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  36.71 
 
 		 249 aa  162  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  37.3 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  31.49 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  30.81 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  31.15 
 
 		 254 aa  88.6  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  28.03 
 
 		 273 aa  88.6  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 282 aa  87  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  30.6 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  24.31 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.92 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  29.01 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  22.4 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  28.47 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  29.5 
 
 		 242 aa  67  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  28.46 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  25.18 
 
 		 252 aa  62  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  28.35 
 
 		 205 aa  62  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  26.81 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  24.07 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  25.6 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  23.44 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  26.23 
 
 		 167 aa  52.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  21.67 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  18.95 
 
 		 176 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  24.5 
 
 		 485 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2028  putative regulatory protein  33.73 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1674  transcriptional regulator TrmB  25.41 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>