35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1189 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 237 aa  494  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  33.91 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  32.34 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  34.06 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  37.3 
 
 		 243 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 248 aa  122  7e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 277 aa  92.4  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  26.48 
 
 		 254 aa  92  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  32.14 
 
 		 285 aa  89.4  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  27.27 
 
 		 273 aa  85.1  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  24.79 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  32.65 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  27.31 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.46 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  24.79 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  27.74 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  29.93 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 		 485 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  24.89 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  26.38 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  22.96 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  29.23 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  24.35 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 174 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  25.69 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  28.35 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  25.17 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  25 
 
 		 167 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  24.05 
 
 		 385 aa  50.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  26.72 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  29.63 
 
 		 292 aa  47.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  19.88 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0805  ArsR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.126396  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>