30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2801 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
214 aa  424  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  79.9 
 
 
205 aa  331  6e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  62.5 
 
 
200 aa  244  6.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  63 
 
 
204 aa  213  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  57.89 
 
 
208 aa  205  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
174 aa  94  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  28.29 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  34.23 
 
 
167 aa  70.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  27.69 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  27.61 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  29.5 
 
 
254 aa  63.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  26.12 
 
 
244 aa  62.4  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  28.67 
 
 
248 aa  62  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  29.41 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  26.92 
 
 
243 aa  58.9  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  27.13 
 
 
175 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  26.06 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  29.46 
 
 
176 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  26.98 
 
 
267 aa  55.5  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  28.78 
 
 
237 aa  52.8  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  24.59 
 
 
248 aa  52.4  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  25 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
154 aa  44.7  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.81 
 
 
271 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
114 aa  42.7  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  23.67 
 
 
252 aa  42.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0987  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 
145 aa  42.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  23.81 
 
 
253 aa  42.4  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4271  hypothetical protein  35.71 
 
 
114 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350717  normal  0.351031 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>