62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0760 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  33.73 
 
 
273 aa  144  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  29.27 
 
 
257 aa  123  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  35.71 
 
 
244 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  41.5 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  30.09 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  30.09 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  29.49 
 
 
253 aa  107  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  34.57 
 
 
285 aa  106  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  30.95 
 
 
254 aa  105  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.46 
 
 
271 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  23.95 
 
 
277 aa  99.8  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  25.11 
 
 
254 aa  99.4  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
174 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  25.43 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  34.01 
 
 
242 aa  89.7  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  36.36 
 
 
171 aa  87.8  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  25.32 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  24.53 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  26.03 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  28.05 
 
 
244 aa  82  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  33.81 
 
 
170 aa  81.6  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  28.03 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  23.04 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  27.61 
 
 
200 aa  63.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 
214 aa  62  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
154 aa  62  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  28.57 
 
 
205 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 
219 aa  59.3  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  30.77 
 
 
208 aa  58.5  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  26.88 
 
 
385 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  27.94 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  26.45 
 
 
167 aa  56.6  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  28.07 
 
 
176 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
86 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1733  hypothetical protein  29.32 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0103078  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  28.1 
 
 
175 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1645  ArsR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
166 aa  51.2  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  36.76 
 
 
111 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
196 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
85 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  47.62 
 
 
120 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
108 aa  45.4  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  20.83 
 
 
485 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  34.78 
 
 
113 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  36.07 
 
 
108 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2275  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 
105 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  34.04 
 
 
475 aa  43.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 
115 aa  42.4  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
98 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
98 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
98 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  30.99 
 
 
98 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  30.99 
 
 
98 aa  42.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  30.99 
 
 
98 aa  42.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  30.99 
 
 
98 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  30.99 
 
 
98 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
98 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  27.71 
 
 
106 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  27.71 
 
 
106 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  41.86 
 
 
108 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
108 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>