66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0583 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 170 aa  340  5e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 174 aa  158  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  27.39 
 
 		 200 aa  88.2  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  30.2 
 
 		 204 aa  85.1  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  27.88 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  33.81 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  28.76 
 
 		 205 aa  80.5  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  25 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  28.29 
 
 		 214 aa  77.4  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1645  ArsR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  26.88 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  26.17 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 248 aa  72  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  34.33 
 
 		 253 aa  70.9  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  28.03 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  25.69 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  26.39 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  26.54 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  28.03 
 
 		 257 aa  67  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  26.77 
 
 		 244 aa  64.7  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  26.72 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1674  transcriptional regulator TrmB  28.93 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.12 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  23.56 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  23.97 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  29.03 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  29.1 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  26.81 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1276  hypothetical protein  26.52 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121315 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  22.96 
 
 		 237 aa  57  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  23.13 
 
 		 252 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  25.98 
 
 		 244 aa  51.2  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  22.14 
 
 		 485 aa  50.8  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  24.06 
 
 		 254 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2892  ArsR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 236 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2943  ArsR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 236 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00832197  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2519  ArsR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 236 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0893  ArsR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 236 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0509477  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2830  ArsR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 236 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.509884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0255  ArsR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 236 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.741592  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  28.57 
 
 		 385 aa  46.6  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0490  ArsR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 236 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4486  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.76 
 
 		 242 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000320614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1682  ArsR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 290 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1033  ArsR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 237 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 100 aa  45.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2952  transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 		 239 aa  44.3  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.993569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4600  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.38 
 
 		 248 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.964571  hitchhiker  0.00711376 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1087  ArsR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0669  ArsR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0608  ArsR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0963  ArsR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699714  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0790  ArsR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0967  ArsR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1046  ArsR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1954  hypothetical protein  35.21 
 
 		 120 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03630  ArsR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 232 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00814661  hitchhiker  0.00000000608889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4201  ArsR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 235 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2216  ArsR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 251 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  22.22 
 
 		 242 aa  42  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0370  putative transcriptional regulator  23.94 
 
 		 232 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 127 aa  41.2  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1988  transcriptional regulator, ArsR family  27.12 
 
 		 235 aa  40.8  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.433498  hitchhiker  0.000545084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>