38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2910 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 200 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  63.68 
 
 		 205 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  62.5 
 
 		 214 aa  244  6e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  65.35 
 
 		 204 aa  225  4e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  58.05 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 174 aa  92.8  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  27.39 
 
 		 170 aa  88.2  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  35.38 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  29.21 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  30.17 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  27.61 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  26.27 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  29.46 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  24.59 
 
 		 254 aa  62  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  27.4 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  29.75 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  26.38 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1276  hypothetical protein  23.73 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121315 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  20.83 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  26.98 
 
 		 273 aa  52.8  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  21.67 
 
 		 243 aa  51.6  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.59 
 
 		 271 aa  50.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  45.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1645  ArsR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 166 aa  45.4  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  23.53 
 
 		 253 aa  45.1  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 485 aa  44.7  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  23.97 
 
 		 385 aa  44.7  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  52.38 
 
 		 105 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1674  transcriptional regulator TrmB  24.79 
 
 		 247 aa  42.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  47.92 
 
 		 103 aa  42  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 121 aa  42.4  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 154 aa  42  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 131 aa  41.6  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 93 aa  41.6  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>