28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1061 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 385 aa  759    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  32.84 
 
 		 171 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  24.43 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 485 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  26.88 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  27.94 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  26.11 
 
 		 254 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  27.94 
 
 		 267 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  25.81 
 
 		 255 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 174 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  22.58 
 
 		 254 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0860  regulatory protein, ArsR  38.98 
 
 		 114 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  21.68 
 
 		 277 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 248 aa  50.8  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  24.05 
 
 		 237 aa  50.4  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  25.31 
 
 		 208 aa  50.1  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  25.69 
 
 		 273 aa  49.7  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  24.84 
 
 		 244 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  23.97 
 
 		 219 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 170 aa  46.6  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 		 282 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  23.97 
 
 		 200 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  26.61 
 
 		 205 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 257 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  25.56 
 
 		 257 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  25.9 
 
 		 249 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 102 aa  43.1  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>