27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0805 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0805  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
223 aa  442  1e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.126396  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2028  putative regulatory protein  66.82 
 
 
220 aa  263  2e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0905  ArsR family transcriptional regulator  65.91 
 
 
219 aa  246  2e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0307  regulatory protein, ArsR  50.63 
 
 
80 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1814  ArsR family transcriptional regulator  53.73 
 
 
79 aa  68.9  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346706  normal  0.834101 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  38.89 
 
 
292 aa  60.5  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0687  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
97 aa  58.9  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0139545 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0990  regulatory protein, ArsR  50.75 
 
 
83 aa  58.5  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.683159  hitchhiker  0.00169297 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  45.61 
 
 
118 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1395  Fis family transcriptional regulator  43.21 
 
 
87 aa  56.2  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  50 
 
 
132 aa  54.3  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0264  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
88 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297288  decreased coverage  0.00633224 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0775  putative transcriptional regulator  52.08 
 
 
134 aa  53.9  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.394099 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1759  putative transcriptional regulator  52.17 
 
 
134 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0694565  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1248  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
88 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0703  putative transcriptional regulator  53.06 
 
 
135 aa  52.8  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.286988  normal  0.459468 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1280  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 
120 aa  50.1  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37603  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1862  Fis family transcriptional regulator  41.98 
 
 
87 aa  49.7  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0201  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
86 aa  49.7  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.364749  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1838  putative transcriptional regulator  44 
 
 
120 aa  49.3  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  hitchhiker  0.000363735 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  37.66 
 
 
102 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2088  putative regulatory protein  41.07 
 
 
120 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.373377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
247 aa  45.4  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  30.88 
 
 
112 aa  42.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  31.34 
 
 
237 aa  42.7  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
104 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>