28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0340 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  100 
 
 		 242 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  41.36 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  35.03 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 282 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  34.01 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  35.62 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.38 
 
 		 271 aa  86.7  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 267 aa  86.3  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  31.06 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  31.65 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  27.74 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  29.5 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  24.85 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  26.24 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  23.31 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  27.08 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  21.8 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  21.43 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  25.17 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 174 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 485 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 154 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  23.74 
 
 		 171 aa  43.5  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  25 
 
 		 219 aa  42  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  22.22 
 
 		 170 aa  42  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 117 aa  42  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>