43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3371 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  525  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  55.91 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  53.54 
 
 		 254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 277 aa  199  5e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  28.88 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  28.96 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  32.08 
 
 		 273 aa  99.4  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  25.85 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  30.46 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  27.43 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  28.95 
 
 		 267 aa  86.3  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  26.27 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  30.38 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  27.31 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  31.82 
 
 		 171 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.34 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  22.55 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  30.33 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  28.03 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 282 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  30.17 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  24.66 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  29.27 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  27.73 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  24.11 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  26.28 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  27.08 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  22.31 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  25.81 
 
 		 385 aa  54.7  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 485 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1645  ArsR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 166 aa  49.7  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  20.59 
 
 		 176 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  24.71 
 
 		 326 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 134 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  26.67 
 
 		 118 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 107 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 121 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  19.23 
 
 		 175 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  28.36 
 
 		 109 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 99 aa  42.7  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>