28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1645 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1645  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 166 aa  332  1e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1276  hypothetical protein  34.78 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121315 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1674  transcriptional regulator TrmB  30.38 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  27.88 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  28.69 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  30.83 
 
 		 285 aa  58.2  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  32.17 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  26.77 
 
 		 219 aa  57  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  28.35 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  24.53 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  31.4 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  25.83 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  28.93 
 
 		 248 aa  51.2  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 485 aa  51.2  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  30.25 
 
 		 253 aa  50.8  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  26.02 
 
 		 255 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  25.4 
 
 		 254 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  26.72 
 
 		 208 aa  47.8  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  25.42 
 
 		 267 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 277 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  25.22 
 
 		 200 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  28.77 
 
 		 244 aa  41.2  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0581  hypothetical protein  32.05 
 
 		 121 aa  40.8  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  24.58 
 
 		 244 aa  40.8  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  24.63 
 
 		 243 aa  40.8  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  25.21 
 
 		 273 aa  40.4  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>