33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0840 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  100 
 
 		 205 aa  407  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  79.9 
 
 		 214 aa  331  6e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  63.68 
 
 		 200 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  70.71 
 
 		 204 aa  238  5.999999999999999e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  56.94 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 174 aa  89.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  28.76 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  35.61 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  28.35 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  27.61 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  28.35 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  29.27 
 
 		 255 aa  61.6  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  25.62 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  31.15 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  29.32 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1645  ArsR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  26.47 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 282 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  26.77 
 
 		 267 aa  52.8  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1276  hypothetical protein  25.76 
 
 		 185 aa  52  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121315 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  25.4 
 
 		 175 aa  51.6  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  26.72 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  26.42 
 
 		 253 aa  48.9  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  25 
 
 		 273 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  36.9 
 
 		 292 aa  47  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  26.61 
 
 		 385 aa  45.1  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0419  regulatory protein, MarR  34.48 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 485 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  29.01 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  22.05 
 
 		 257 aa  41.6  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>