25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0419 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0419  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 269 aa  543  1e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2244  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  69.66 
 
 		 269 aa  382  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0183  regulatory protein Crp  67.79 
 
 		 269 aa  373  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.422757  normal  0.155154 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1576  hypothetical protein  63.74 
 
 		 266 aa  364  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0237747 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2502  regulatory protein, Crp  62.5 
 
 		 267 aa  348  4e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0976  regulatory protein, ArsR  57.25 
 
 		 263 aa  293  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.262232  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1233  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  52.14 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2036  hypothetical protein  48.44 
 
 		 262 aa  261  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.286499  normal  0.372572 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.036138  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1289  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  42.19 
 
 		 258 aa  211  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1499  hypothetical protein  42.19 
 
 		 258 aa  211  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.29326  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1274  hypothetical protein  41.02 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0378211  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2506  regulatory protein IclR  44.27 
 
 		 259 aa  206  5e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174679  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1308  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2060  regulatory protein Crp  38.26 
 
 		 268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0023  regulatory protein Crp  40.16 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.780112  normal  0.0232711 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2797  transcriptional regulator, MarR family  45.33 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0223  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  35.83 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0375  regulatory protein Crp  31.62 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1606  regulatory protein Crp  31.87 
 
 		 269 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.296592  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0306  regulatory protein Crp  31.47 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.54 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1157  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.13 
 
 		 261 aa  126  5e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  34.48 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3452  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 234 aa  42.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>