25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2506 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2506  regulatory protein IclR  100 
 
 
259 aa  498  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174679  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1308  transcriptional regulator, MarR family  81.47 
 
 
259 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2797  transcriptional regulator, MarR family  69.92 
 
 
254 aa  301  5.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2060  regulatory protein Crp  49.02 
 
 
268 aa  228  7e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2036  hypothetical protein  38.52 
 
 
262 aa  208  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.286499  normal  0.372572 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0419  regulatory protein, MarR  44.27 
 
 
269 aa  206  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.98 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.036138  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1233  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  39.38 
 
 
264 aa  196  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2502  regulatory protein, Crp  37.55 
 
 
267 aa  183  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1576  hypothetical protein  36.43 
 
 
266 aa  182  7e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0237747 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1289  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  39.06 
 
 
258 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1499  hypothetical protein  39.06 
 
 
258 aa  180  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.29326  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2244  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.43 
 
 
269 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1274  hypothetical protein  38.67 
 
 
258 aa  178  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0378211  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0023  regulatory protein Crp  46.69 
 
 
267 aa  178  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.780112  normal  0.0232711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0183  regulatory protein Crp  35.97 
 
 
269 aa  168  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.422757  normal  0.155154 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0976  regulatory protein, ArsR  36.44 
 
 
263 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.262232  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0306  regulatory protein Crp  30.83 
 
 
269 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0223  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.62 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.06 
 
 
269 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1606  regulatory protein Crp  28.06 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.296592  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0375  regulatory protein Crp  27.67 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1157  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.57 
 
 
261 aa  102  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0226  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 
156 aa  43.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000277932  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  34.38 
 
 
439 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>